地下城与勇士（DNF）的剧情并非简单的勇者打怪，而是一部围绕“使徒”与“阿拉德”命运的多线叙事。故事始于远古时代，十二位使徒因“伟大意志”的意志降临宇宙，各自拥有毁灭性力量。其中，卡恩（第一使徒）、赫尔德（第二使徒）等被封印在魔界，但他们的存在与阿拉德大陆的存亡紧密相连。冒险家所处的阿拉德，是赫尔德的“创世纪”计划中的关键棋子，她试图通过转移使徒来重建自己的世界，却导致大陆多次濒临崩溃。
主线最著名的篇章是“悲鸣洞穴事件”。使徒希洛克被转移到悲鸣洞穴，其精神污染导致周围生物变异，四大剑圣（西岚、阿甘左、巴恩、布万加）与神枪手卢克西联手讨伐，最终卢克西牺牲生命斩杀希洛克。这一战不仅确立了冒险家的地位，也揭开了使徒转移的阴谋——赫尔德暗中操控一切。此后，狄瑞吉（第六使徒）被转移至诺伊佩拉，引发瘟疫；奥兹玛（伪装者之王）在暗黑圣战中被封印，却又因时空裂缝蠢蠢欲动。
“大转移”是剧情的重要转折。在《DNF》编年史中，由于第二使徒赫尔德的计划，大转移导致阿拉德大陆地理巨变：赫顿玛尔沦为废墟，天空之城崩塌，虚祖与德洛斯帝国被隔断，无数居民失踪。冒险家被迫踏上流亡之路，来到新生的“银色村庄”，并结识了记忆丧失的卡坤、精灵使凯丽等人。这一事件彻底改变了原有地图和任务线，也催生了“时间与空间”错乱的新副本，如“时间广场”与“魔界裂缝”。
随着剧情推进，冒险家开始追寻“命运之书”与“创神宇宙”的真相。在“天界”篇中，冒险家帮助皇女艾丽婕对抗卡勒特组织，揭露了机械七战神的历史，并发现天界与魔界之间的链接。而在“魔界”篇，冒险家穿梭于地狱界、时间空域，面对使徒卡西利亚斯（第四使徒）的挑战，甚至与赫尔德正面交锋。这些故事揭示了“使徒并非绝对邪恶”——他们多为被命运捉弄的星灵，而赫尔德的复仇计划实则源于母星的毁灭。
阿拉德大陆的势力错综复杂：佩鲁斯帝国后裔的德洛斯帝国，玄奥的虚祖抗魔团，科技与魔法共存的天界，以及暗黑城中的暗精灵女王与“阿法利亚营地”。这些地理与政治设定为剧情提供深厚土壤，如“暗黑城入口”副本便浓缩了暗精灵对人类的敌意与和解。冒险家的选择会通过“剧情地下城”或“史诗任务”影响支线结果，例如拯救或牺牲某位NPC，这种分支隐藏在“再战魔界”等版本中。
经典事件还包括“时空之门”与“讨伐安徒恩”。在时空之门中，冒险家回到过去，参与卡修派与帝国战争，揭示阿拉德历史的循环性。而巨型使徒安徒恩（第七使徒）被转移至苍穹贵族号，引发工业城市“克洛诺斯岛”的危机，玩家通过团队副本“安徒恩攻坚”体验20人协作，最终将其击败，却意外释放了能量，导致“黑色火山”与“圣者之鸣号”的后续故事。这些事件不仅塑造了核心玩法，更让玩家成为史诗的书写者。
纵观DNF剧情，它交织了创世神话、物种冲突、科技伦理与人性抉择。冒险家从最初的佣兵到救世主，最终直面“超越者”——将世界拉入永生轮回的强敌。但无论局势如何绝望，故事始终强调“希望”与“羁绊”，如冒险家与NPC同伴的情谊，或对逝者如艾丽丝的追忆。这种在废墟中复苏的主题，正是DNF叙事最动人之处。